ジョエルと申します。

> ...
> kill `cat /mysql-data-directory/hostname.pid`
> を試してみようとしていますが、
> localhost.localdomain.pid
> というファイルはあるのですが、中身は空で、
> よくわからないまま、

    ps -a 

若しくは

    sudo ps -a 

をつかって pid を調べることできると思います。

-- 
Joel Rees <joel@xxxxxxxxxx>