渋谷です。

最近はもっぱら Cobalt 用の RPM ばっかり作ってますが。

>１）php-3.0.6-kanji-4.patch.gzのパッチをあてるとrejファイ
>   ルが結構でました。
>   rejファイルを見ると、バージョン管理ツールの足跡？の違い
>   がある様子で？？？ ここでrejを吐いている様子でした。

確か rej ファイルができた場合は、rej ファイルの中身のパッチがあたっていない
と
思います。rej ファイルの中身とパッチをあてたファイルの該当部分を見比べてみて
ください。

shibuya@xxxxxxxxxx