はせがわです。

とりあえず報告です。

http://www.redhat.com/support/errata/RHSA-2001-001.html
にて、glibc-2.2-12にした上、
http://www.redhat.com/support/errata/RHBA-2000-132.html
GCCを2.96 
とアップグレードしました。

どちらも忘れてはならないようです。

これで、srpmをコンパイルすると、無事myisamchkが動作するように
なりました。

export MYSQL_BUILD_CC=gcc
export MYSQL_BUILD_CXX=g++
の設定変更もやってみました。c++でもどちらでも通りましたが、
g++のほうが望ましいですよね。
ありがとうございました。