樋口です。お世話になっています。

菅原様、情報ありがとうございます。
MERGE テーブルが扱える行数の上限に達したのですね。
MySQL 5.0.4 以降への切り替えを検討したいと思います。
本当にありがとうございました。

>> 10テーブルでは、約4,000,000,000件となり、
>> 11テーブルでは、約4,400,000,000件となります。
>> もしかすると MySQL が扱うことができるデータ件数の上限に
>> 達したと考えた方がよいのでしょうか？
> 
> 　これかな？
> 
> http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/ja/merge-table-problems.html
>> MyISAMにもあるように、MERGE テーブルにも2^32 (~4.295E+09)行の制限があ
>> ります。その為、この制限を越える複数のMyISAM テーブルをマージする事は
>> できません。しかし、 MySQLを --with-big-tables オプションで作成すると、
>> 行の制限は (2^32)^2 (1.844E+19) 行に増加します。詳しくは項2.9.2. 「典
>> 型的な configure オプション」を参照してください。MySQL 5.0.4バージョン
>> より、全ての標準バイナリはこのオプションで作成されます。

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インテック・ウェブ・アンド・ゲノム・インフォマティクス株式会社
樋口  俊夫
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