立岡です。

> 私のところでは FreeBSD上で MySQL4.1.21 を使用していますが、
> 2007年1月以降は、Extended Support 契約をしない場合は、セキュリティホールが
> 見つかっても、パッチや新しいリリースは入手できないって事でしょうか？

今までの流れからすると、4.1系のソースツリーには今後パッチは加わらないと
思います。上記のような問題が起きても5.0系のソースにパッチが提供されるで
しょうからそちらを使ってくださいという判断になるでしょうね。
どうしても4.1でないとダメな理由があればExtended Supportを買えばいいと思
いますが、4.1->5.0へのアップグレードであればそんなに互換性の問題は起きな
いのではないかと思います。