坂井様、お世話になります。

Threads_connectedはストレステスト前とあまり変わりません
でした。接続が残っているような事はないようです。

天野様が言っているように、
MySQLサーバをインストールしているOS(Windows2003Server、WindowsXP)
に何か問題があるのではないでしょうか？
そうなると、原因解決は難しくなりますが。

では。

> 話の流れを拝見しているとクライアント側の問題の可能性が
>   高いようですが、
>  
> 念のためサーバー側のコネクションを食いつぶしていないこ
とを、
>  
> ストレステスト中にmysqlコマンドラインクライアントから
接続して
>   
> mysql> show status like "%conn%";
>   
>   などで確認してみてはどうでしょう。
>   たとえば Threads_connected
> が、今まさに接続されている数、です。