小泉です。
すばやいレスありがとうございます。

> PHP-ML でお見受けしました（ｗ
お恥ずかしいですが、LINUXで環境を作ろうとしているので
どうしても分からない事だらけで。。。
Vineに変更しようかとも考えはじめてます(-_-;)

> mysql というユーザは存在しますか？
> netstat -a | grep 3306 で立ち上がってるプロセスありませんか？
> /var/lib/mysql というディレクトリはありますか？
> mysql_install_db は実行しましたか？
上記は問題ありません。
netstat -a | grep 3306　は実行しましたが何も表示されませんでした。


> rpm は良く知りませんが、コンパイルしたなら rpm は関係無いで
> すよね？(FreeBSD の package と同じと思ってる＜自分）
MySQLサイトのSource downloadsからTar.gzをダウンロードしました。


> それにしても 3.23.58 とは古い(^^;
> システムに存在する mysql がらみ、全部見直した方が良いかもで
> すね。
apt-getで行うとこのバージョンが最新になるようです。
見直す(VerUpする)という事は、MySQL-5.0.15-0.src.rpmを
ダウンロード⇒リビルド⇒インストール
という事であっていますでしょうか？