中村＠東京です。

> ALTER TABLEのauto_incrementで
> alter table test auto_increment = 110000;といった具合にすると以下の
> ような結果が得られる。
>
> Query OK, 5 rows affected
> Records: 5  Duplicates: 0  Warnings: 0
>
> これで、6件目からはidは110000からのスタートになるかと思います。が、
> 5 rows affected(影響範囲5)これは、レコードを上から順に総なめで見て
> るのだと思うのですが、上から順に見る必要など果たしているのだろうか？

「PRIMARY KEY  (`id`)」だから重複してないかの確認に一票。